Мне даже читать про это страшно((((( То что описываете,я бы подумал что это паразиты или инфекция.

Зря вы отвоёвываете право на исключение от правил. Если вам действительно важна причина то да, механическое повреждение наиболее вероятная. И да, драки самая частая причина механических повреждений на морде. Любых. То, что вы ничего такого не видели, совсем не значит что ничего не было. Драки не всегда слышны и заметны, не всегда они начинаются сразу после ссаживания и далеко не всегда вы заметите последствия во время. Кстати, а что там с детьми? Предположу что они были, но ежи их уничтожили сразу после рождения.
Наиболее вероятной мне видится следующая последовательность: у вашей самочки произошло повреждение глаза, которое вы сразу не заметили. Началось воспаление - глаз спасти не удалось, но ёж выжил. По определению такой ёжик будет слабее среднего, потому как организм потратил огромный ресурс на выживание и восстановление. Скорее всего инфекция в организме осталась жить, но в латентном состоянии. Потом произошло что-то что немного повредило глаз самцу. Скорее всего драка. Менее вероятно, но тоже возможно, просто случайное попадание в глаз иголкой, например пока они вместе склонились над миской или поилкой. Ещё один вариант, в клетке есть что-то что опасное. Слишком острый угол домика, торчащий прут, сено/солома в подстилке, или вы их выпускаете гулять без присмотра и тогда это может быть что угодно.
Короче самец повредил глаз, и точно так же началось воспаление. С большой долей вероятности инфекция была уже прижившаяся от самочки. Бактериальная инфекция. Кстати это лечится, но только на самых ранних стадиях. Когда глаз только начал краснеть, но не опухоли не гноя ещё нет. Антибиотики внутрь, дезинфекция, безопасная для слизистой наружу. Простым языком уколы или капли в рот с антибиотиком 4-5 раз в день и столько же раз промывание специальным раствором. В течении недели. Это те удачные случаи излечивания которые мне известны. Ёж на это время селится на бумажные полотенца (никакого песка или любых сыпучих наполнителей) и к качестве укрытия только твёрдый домик (никаких спальных мешков и тряпочек). И естественно никакого вольного выгула и "друзей/подруг".

Что я бы вам посоветовала делать сейчас:Естественно никаких контактов между ежами больше никогда. Внимательно пересмотрите условия их жизни. Самцу сейчас только бумажные полотенца и твёрдый домик. Температура, колёса, наполнители и самое главное питание. У вас уже по определению слабые ежи. Очень важно не ослаблять их ещё больше неправильным питанием. И лечение, с которым помочь может только ветеринар.

Э... Половозрелыми ежи самцы становятся в 5 недель. Очень сомневаюсь что ваш был младше всё время пока ежи сидели вместе.
Откуда взялось про сына?

Тогда не совсем понятно чего вы спрашиваете. Если ветеринары всё знают. А вы у них уже поинтересовались.
В общем ни у одной известной мне породы ежей половое созревание не наступает так поздно. А из всех остальных, декоративные африканцы созревают быстрее всех.  В 5 недель отсаживают мальчиков от мам. В 10 уже вполне ссаживают с самочками с целью размножения. Пять месяцев самый оптимальный срок для первой беременности самочки, если она подходит для размножения.
Короче 4 месяца вместе это скорее всего два погибших помёта, если ваша самочка после болезни вообще способна к зачатию.
Мой первый ёжик точно так же как ваш потерял глаз. Это было 9 лет назад. Я точно так же как и вы неправильно содержала ежа, не заметила сразу начинающуюся проблему, пропустила момент когда это ещё поддавалось лечению, и как результат мой Аватар прожил всего три года и имел другие проблемы со здоровьем, связанные с тем самым неправильным содержанием.
Для меня чувство вины послужило огромным стимулом для изучение всей доступной мне информации по ежам на всех языках которыми я владею.  Да, со всем что происходит в питомцем виноват владелец. Я в это искренне верю и это очень стимулирует. Сейчас мои ежи живут по 6 лет и самая страшная проблема это перхоть. И то, последний раз случилась два года назад.
Надеюсь вы придёте к выводам похожим на мои и будете искать информацию и дальше и менять жизнь своих любимцев к лучшему. Настолько, насколько это возможно на данном этапе.